林權分散，整合難度大。2008 年 6 月國務院出臺了《全面推進集體林權制度改革的意見》，在堅持集體林地所有權不變的前提下，依法將林地承包經營權和林木所有權通過家庭承包方式落實到本集體經濟組織的農戶，從此林地承包經營權和林木所有權就分散在各個林農手中。單個林農開發碳匯的規模很小，成本很高，方法學又相對復雜，很難獲得經濟收益，林農自主開發林業碳匯項目很難克服投資障礙和技術障礙。