在⑤資產運營階段，對于專項計劃通過運營收取試點前開工的高速公路通行費，應按財稅【2016】47 號規定征收增值稅，簡易計稅征收率為 5%；同時財稅【2006】5 號規定受托機構從信貸資產信托項目中取得的貸款利息收入應全額征收增值稅，運營階段的增值稅是免不了的。按財稅【2017】56號規定，公募基金投資資產支持計劃過程中發生的應稅行為適用增值稅簡易計稅，征收率 3%。對于企業所得稅，財稅【2006】5號規定信貸資產支持證券在取得收益當年向機構投資者分配的部分，信托環節暫不征收企業所得稅，由機構投資者環節繳納；在取得當年未向機構投資者分配的部分，由專項計劃繳納企業所得稅，已完稅收益再分配時無需征稅（除非存在稅率差異）。因此，稅法模糊的地方在于 REITs基金是否應征企業所得稅——財稅【2008】1號規定證券投資基金的價差和投資收益均不征收企業所得稅，這與上述“機構投資者環節繳納企業所得稅”形成矛盾。未來公募基建 REITs究竟如何適用稅法，或有待進一步明確。