農研公司研發能力強勁，具有大量知識產權。農研公司主要從事新化合物設計與合成、生產工藝開發、農藥劑型加工、生物活性篩選，建有國內農藥行業目前唯一的新農藥創制與開發國家重點實驗室和農藥國家工程研究中心。農研公司開發了多個農藥新品種，包括氟嗎啉、四氯蟲酰胺、乙唑螨腈均成為國內市場上的主導產品，其創制的新型殺菌劑氟嗎啉是國內第一個獲準正式登記的具有自主知識產權的農藥產品。截至 2018 年 12 月 31 日，農研公司擁有的主要境內專利多達 286 項，主要境外專利多達 62 項。