由于硅烷的保護和去保護反應的轉化率高，甚至是定量反應，因此基團保護劑被廣泛應用于藥物的合成中。六甲基二硅氮烷作為醫藥基團保護劑，具有安全穩定、易結合易脫除等優勢，被大量應用于頭孢菌素、盤尼西林、拉米夫定、齊多夫定、吉西他濱、卡培他濱、瑞舒伐他汀、阿托伐他汀等藥品合成，其中頭孢菌素、盤尼西林為抗生素，拉米夫定、齊多夫定為乙肝、艾滋病的核苷類抗病毒藥物，吉西他濱、卡培他濱為抗腫瘤藥物，瑞舒伐他汀、阿托伐他汀為心腦血管疾病藥物。其中，中國抗生素需求量自 2016 年觸底后的三年內持續增長，預計 2020 年我國抗生素制劑市場規模為 1,780.59 億元，復合增長率為 5.27%。拉米夫定為第一代核苷類抗病毒藥物，已成為國際上治療乙肝的主流用藥，預計 2020 年，我國乙肝用藥市場規模將達到 200 億元。近年來，艾滋病感染人數逐年增長，近五年全球抗 HIV 病毒藥物市場規模也在快速增長，預計 2020 年全球抗 HIV 病毒藥物市場規模超 400 億美元，增速超 10%。隨著我國腫瘤藥物市場超 10%的高速增長，預計我國 2020 年腫瘤藥物市場規模將觸及 300 億美元。瑞舒伐他汀和阿托伐他汀這兩種心腦血管疾病藥物，在全國樣本醫院的的銷售情況自 2019 年 Q1 達到高點后有所回落，但仍保持較高銷售額水平。