基因測序發展受制于高額成本，NGS 的出現使得測序成本以超摩爾定律速度下降，推動商業化應用。根據美國國家衛生院數據，隨著高通量測序技術的大規模使用，人類全基因組測序的成本實現了快速的降低，在 2009 年降低至 10 萬美元左右，在 2015 年已降低至 1,000 美元左右。2022 年 Illumina 的 NovaSeqX系列將全基因組測序成本降低至 200 美元；2023 年華大智造發布的超高通量測序儀 DNBSEQ-T20×2 可實現單例成本低于 100 美元。測序成本的降低為應用拓展帶來更多可能。