煤制氫成本略低于天然氣制氫成本，制氫成本受原料價格影響較大。根據苗軍等《氫能的生產工藝及經濟性分析》，煤氣化制氫技術能量轉化效率在 55%-60%，天然氣水蒸氣重整制氫技術能量轉化率可達 70%以上。根據張彩麗《煤制氫與天然氣制氫成本分析及發展建議》，以工業制氫所需獨立制氫裝置規模最小 90000m3/h 為基礎，年運行時間為 8000h，則煤制氫建設投資為 12.4 億元，天然氣制氫建設投資為 6 億元。根據中國煤炭工業協會《2022 煤炭行業發展年度報告》，2022 年動力煤中長期合同（5500 大卡下水煤）全年均價為 722 元/噸，假設 2022-2030 年期間 5500 大卡煤炭價格穩定在 700 元/噸，熱值為22990KJ/kg。各地工業天然氣市場價格大約在 1.5-3.5 元/m3之間，假設 2022-2030 年期間工商業用氣天然氣價格穩定在 2.5 元/m3，熱值為 35948KJ/m3。在不考慮碳稅的情況下，當前煤炭單位制氫成本為 11.60 元/kg，其中煤炭成本占總成本 50%以上；天然氣單位制氫成本為 12.57 元/kg，略高于煤制氫成本，其中天然氣成本占總成本 70%以上。由于煤炭和天然氣成本占化石燃料制氫總成本比例較高，化石燃料制氫成本受原料價格變化影響較大。當煤價為 550 元/噸時，單位煤制氫成本為 10.34 元/kg；當煤價為 800 元/噸時，單位煤制氫成本增至 12.44 元/kg。當天然氣價格為 1.5 元/Nm3時，單位天然氣制氫成本為 8.87 元/kg；當天然氣成本為 3.5 元/Nm3時，單位天然氣制氫成本則增至 16.32 元/kg。