1.什么是基因芯片
基因芯片指的是在很小的載玻片等載體上,以大規模隊列形式有序排列著大量的寡核苷酸,每個核酸分子都固定在芯片上可找尋的特定位置上,可以反映芯片上大量的拷貝互補信息,如基因表達譜鑒定,DNA序列測定,基因突變體檢測分析等?;蛐酒夹g是一項由分子生物學、微電子學等多個學科交叉融合而成的新型高新檢測技術。

2.基因芯片的分類
基因芯片類型較為繁多,可以依據不同的分類方法進行分類,一般可分為以下幾種:
(1)按照載體上所添加DNA種類的不同,基因芯片可分為寡核苷酸芯片和cDNA芯片兩種:寡核苷酸芯片一般以原位合成的方法固定到載體上,具有密集程度高、可合成任意系列的寡核苷酸等優點,適用于DNA序列測定、突變檢測、SNP分析等;其缺點是合成寡核苷酸的長度有限,因而特異性較差,而且隨著長度的增加,合成錯誤率增加。寡核苷酸芯片也可通過預合成點樣制備,但固定率不如cDNA芯片高,寡核苷酸芯片主要用于點突變檢測和測序,也可用作表達譜研究。cDNA芯片是將微量的cDNA片段在玻璃等載體上按矩陣密集排列并固化,其基因點樣密度雖不及原位合成寡核苷酸芯片高,但比用傳統載體的點樣密度要高得多,cDNA芯片最大的優點是靶基因檢測特異性非常好,主要用于表達譜研究。
(2)按照載體材料分類:載體材料可分為無機材料和有機材料兩種,無機材料有玻璃、硅片、陶瓷等,有機材料由有機膜、凝膠等。膜芯片的介質主要采用的是尼龍膜,其陣列密度比較低,用到的探針量較大,檢測的方法主要是用放射性同位素的方法,檢測的結果是一種單色的結果。而以玻璃為介質的芯片,陣列密度高,所用的探針量少,檢測方法具有多樣性,所得結果是一種彩色的結果,與膜芯片相比,結果分辨率更高一些,分析的靈活性更強。
(3)按照點樣方式的不同可以分為原位合成芯片、微矩陣芯片、電定位芯片三種。
3.基因芯片特點分析
(1)高通量、多參數同步分析。目前基因芯片制作工藝可達到在25px2的載體平面上固定數萬至數十萬的探針,可對樣品中數量巨大的相關基因,甚至整個基因組及信息進行同步檢測和分析。
(2)快速全自動分析。在一定的條件下使樣品中的靶基因片段同時與芯片的多個探針進行雜交,并采用掃描儀器測量雜交信號和分析處理數據。從而,從根本上提高了測量工作的速度和效率,也極大降低了測量工作的強度和難度。
(3)高精確度分析。由于芯片上的每一點,即每個探針都可以精確定位和選址,加上每個探針都可以精確設計及制備,因此可以精確檢測出不同的靶基因、同一靶基因不同的狀態以及在一個堿基上的差別。
(4)高精密度分析。商品化芯片制作上的精密及檢測試劑和方法上的統一在一定程度上保證了芯片檢測的高精密度和重現性,使不同批次乃至不同實驗室之間的檢測結果,可以進行有效比對及分析。
(5)高靈敏度分析?;蛐酒x用了不易產生擴散作用的載體,探針及樣品靶基因的的雜交點非常集中,加上雜交前樣品靶基因的擴增和雜交后檢測信號的擴張,極大地提高了檢測的靈敏度,可以檢測出1個細胞中低至1個拷貝的靶基因,從而使檢測所需的樣品量大幅度減少,一般只需要10~20μL樣品。
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