NPS 主要用主動管理進行股票投資。NPS 的股票投資分為被動和主動管理兩種方式，被動管理側重于穩定性和流動性，由內部投資專業人員和外部管理人員實施；而主動管理旨在通過謹慎的證券選擇產生相對于風險的超額回報，整個主動管理組合由外部管理人員進行。截至 2023 年末，國內股票投資組合中被動管理和主動管理的比例分別為 29.7%和 70.3%，國外股票投資組合中被動管理和主動管理的比例分別為 46.9%和 53.1%。