近年來，除了疫情沖擊之外，安全事故對華夏航空的生產經營也造成了較大不利影響。2021 年 7 月 5 日，華夏航空 CRJ900 執行延安-武漢航班時，機組誤將跑道邊線識別為中心線起飛，造成五個燈損壞（三個跑道邊燈、兩個滑行道邊燈），飛機左主輪扎傷；2021 年 8月 29 日，華夏航空 G54394 航班在新疆阿克蘇機場著陸過程中滑出跑道，造成 4 名旅客受到輕微擦傷，飛機整體完整，沒有著火等情況發生。兩月發生兩起安全事件，民航重慶監管局對公司的整體日常飛行運行品質、運行現狀及綜合實力進行評估后對公司實施航班運行總量調控，由此公司航班量恢復受到限制。