維亞還利用 AI 積極探索從頭設計這種藥物設計新思路。從頭設計在計算化學領域由來已久，近幾年來得到廣泛關注和探究的生成式 AI 讓這一思想在實踐場景中能更充分的轉化和落地，真正突破原有的化合物篩選和設計的限制，找到和靶標“完美匹配”的新穎分子。從頭設計從根本上顛覆了原有的藥物設計邏輯，跳過原本耗時數月的藥物篩選流程一步到達苗頭化合物發現的里程碑，再加上 FEP 對先導化合物優化階段的效率加成，研發速率達到數量級上的提升。維亞生物計算平臺不僅擁有對從頭設計算法的把控，還基于對藥物設計的深入理解在各個環節引入實驗驗證，特別是對生成分子的可合成性、類藥性等指標做迭代驗證，確保新方法在各個層面的可靠性。圖 34展示了基于蛋白口袋的從頭設計分子（粉色）與已知晶體結構中小分子（綠色）的疊合圖，這一設計兼具相互作用模式的相似性和分子的新穎性，為藥物設計打開新思路，為創造新的分子提供無限可能。