主流的膠原蛋白提取和制備方法包括動物源提取和基因工程法兩大類，動物源提取相對成熟，但存在一定限制，以基因工程技術生產重組膠原蛋白為目前學界及業界研究的重點。動物源膠原蛋白的提取主要通過酸法和酶法進行產業化制備，成本相對更低，但同時具備一定局限性：（1）存在動物源疾病感染風險；（2）異體膠原蛋白可能導致免疫排斥或過敏反應；（3）產能限制；（4）提取物往往是不同分子量膠原蛋白的混合物，純度難以把控，延伸應用受限；（5）動物源性膠原蛋白變性溫度為 40 度，儲存運輸難度大。以基因工程技術生產重組膠原蛋白為目前學界及業界研究的重點。重組膠原蛋白是通過基因工程技術，將人體膠原蛋白基因進行特定序列設計、酶切和拼接、連接載體后轉入工程細胞，通過發酵表達生產膠原蛋白。該方法得到的產物具有安全性好、加工性強、質量穩定等優點，但技術難點在于如何實現菌種、酵種的高密度表達、保證生物活性以及對重組蛋白的分離純化。