磷酸錳鐵鋰仍存在一些不足阻礙其產業化進程：1）導電性差、倍率性能差：磷酸錳鐵鋰的電子電導和離子電導性均顯著低于三元材料和磷酸鐵鋰，因而表現出較差的導電性和較差的倍率特性。2）首圈效率低：磷酸錳鐵鋰首圈充放電效率在92%左右，而磷酸鐵鋰能夠做到 95%以上。3）錳溶出導致循壞壽命衰減。而在實際應用中，企業多采用包覆、摻雜、納米化等方式來對其進行改性。