單分子測序讀長較長，但測序錯誤率整體較高，需輔以重復測序或軟件算法糾錯，且比其他測序技術成本總體更高、通量與準確性更低，應用場景有所限制，目前市場份額不足 4%，科研端應用包括基因組組裝、組學研究、人群隊列研究等領域，臨床端應用較少。