不同品種間工廠化差異大，金針菇、杏鮑菇、真姬菇工廠化率高。當前國內外實現工廠化生產的食用菌主要有金針菇、真姬菇、杏鮑菇、雙孢蘑菇等。根據統計，2021 年金針菇、杏鮑菇和真姬菇的工廠化率均超過 50%。金針菇 2021 年工廠化率為 52.54%，與 2018 年、2019 年變化不大。杏鮑菇 2021 年工廠化率為 32.55%，較 2019 年下降了 23.68%。真姬菇（白玉菇、蟹味菇、海鮮菇統稱為真姬菇）2021 年工廠化率為 67.22%。雙孢蘑菇由于單噸投資額大，故當前在國內發展較慢，工廠化率一直不高，但工廠化率整體呈上升趨勢，從 18 年的 5.91%上升到 21 年 17.37%。