在眾多靶點中，3CL 抑制劑在療效和安全性方面具備優勢。當前全球已獲批上市的新冠小分子口服特效藥有默沙東的莫努匹韋（Molnupiravir）和輝瑞的奈瑪特韋（Paxlovid），其中奈瑪特韋為 3CL抑制劑，在臨床試驗中使輕型和普通型且伴有進展為重癥高風險因素的成人住院或死亡風險降低了 89%，在療效和安全性方面均優于 RdRp抑制劑莫努匹韋。當前奈瑪特韋已占據美國地區新冠治療小分子藥物分發數據的 83%。2022 年 2 月，輝瑞發布公告稱根據截至 2022 年 1月下旬已簽約的合同以及承諾交付的療程數，預計 2022 年奈瑪特韋的銷售收入可以達到 220 億美元。